入门
在 Duaer 里检索互作
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索 STRING 蛋白互作伙伴。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。
能拿到什么
Duaer 数据市场里的「互作」检索 STRING 蛋白互作伙伴。一次成功查询 1 额度。
从节点创建器的 Duaer 数据分类 选「互作」,或打开 数据市场 复制技能。基因符号见 基因;蛋白见 基因和蛋白;物种 Taxonomy ID 见 物种。
在画布里检索
- 打开节点创建器,点「Duaer 数据」,再选「互作」。
- Protein 必填(新节点默认 INS)。Species 默认 9606;Required score 可选(0–1000)。
- Limit 默认 10,最大 20。点执行此步骤。
成功扣 1 额度。正式运行的交付进 数据池。
用 API 调用
- GET https://api.duaer.com/v1/data/interactions?...
- Authorization: Bearer <Duaer key>
- 必须提供 protein。
密钥见 Duaer 公开 API 的身份验证。下方是与「复制技能」相同的英文技能。
调用技能(英文)
与数据市场「复制技能」一致。正文保持英文。
---
name: duaer-interactions
description: >-
Search STRING protein interaction partners through Duaer.
One successful search uses 1 Duaer credit.
---
# Duaer interactions
Search STRING protein interaction partners through Duaer with a Duaer key.
## Call
`GET https://api.duaer.com/v1/data/interactions?protein=INS&species=9606&limit=10`
Header: `Authorization: Bearer <Duaer key>`
Use an account key or a model API key.
`protein` is required. Other fields are optional.
- `protein` — gene symbol, UniProt accession, or STRING id. Look up symbols with https://skills.duaer.com/genes.md or proteins with https://skills.duaer.com/proteins.md.
- `species` — optional. NCBI taxonomy id. Default `9606` (human). Look up ids with https://skills.duaer.com/organisms.md.
- `requiredScore` — optional. STRING threshold from 0 to 1000. Omit for the STRING default.
- `limit` — optional. From 1 to 20. Default 10.
## Result
Each item has `source`, `title`, `url`, `summary`, `proteinA`, `proteinB`, `stringIdA`, `stringIdB`, `partner`, `partnerStringId`, `score`, `neighborhood`, `fusion`, `cooccurrence`, `coexpression`, `experimental`, `database`, `textmining`, and `taxId`.
Reuse `partner` as `gene` when searching proteins, or as `protein` for further interaction partners.
## Credits
One successful search uses 1 credit.
An empty search, a failed search, a compound that matches nothing, or no remaining credits uses 0.
No remaining credits returns 402 and does not search.
A missing key returns 401.
常见问题
partner 字段是什么?
相对查询蛋白的互作伙伴基因符号;可用它再查蛋白或继续查互作。
同组
入门
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在 Duaer 里用 Duaer Data 检索基因和蛋白。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。
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在 Duaer 里用 Duaer Data 检索基因。一次成功查询 1 额度。符号可用于蛋白 Gene。本页含完整英文调用技能。
入门在 Duaer 里检索物种
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索 UniProt 物种分类。一次成功查询 1 额度。学名可用于蛋白与结构检索的 Organism;taxonId 可用于 Taxonomy ID。本页含完整英文调用技能。
入门在 Duaer 里检索表达
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索 GTEx 组织中位表达。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。
入门在 Duaer 里使用数据市场
在 Duaer 里,数据市场列出能取到的数据、能拿到什么、以及价格。侧栏在数据池正下方。打开目录不会发起检索。