入门
在 Duaer 里检索表达
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索 GTEx 组织中位表达。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。
能拿到什么
Duaer 数据市场里的「表达」检索 GTEx 各组织中位 TPM。一次成功查询 1 额度。
从节点创建器的 Duaer 数据分类 选「表达」,或打开 数据市场 复制技能。基因符号见 基因;蛋白见 基因和蛋白;基因–疾病关联见 靶点关联。
在画布里检索
- 打开节点创建器,点「Duaer 数据」,再选「表达」。
- Gene 或 Gencode ID 至少填一项(新节点默认 Gene=INS)。Tissue 可选(如 Pancreas)。
- Limit 默认 10,最大 20;结果按中位 TPM 降序。点执行此步骤。
成功扣 1 额度。正式运行的交付进 数据池。
用 API 调用
- GET https://api.duaer.com/v1/data/expression?...
- Authorization: Bearer <Duaer key>
- 必须提供 gene 或 gencodeId。
密钥见 Duaer 公开 API 的身份验证。下方是与「复制技能」相同的英文技能。
调用技能(英文)
与数据市场「复制技能」一致。正文保持英文。
---
name: duaer-expression
description: >-
Search GTEx median tissue expression through Duaer.
One successful search uses 1 Duaer credit.
---
# Duaer expression
Search GTEx median tissue expression through Duaer with a Duaer key.
## Call
`GET https://api.duaer.com/v1/data/expression?gene=INS&limit=10`
Header: `Authorization: Bearer <Duaer key>`
Use an account key or a model API key.
At least `gene` or `gencodeId` is required.
- `gene` — gene symbol. Look up symbols with https://skills.duaer.com/genes.md.
- `gencodeId` — optional. Ensembl/Gencode id from a result, such as `ENSG00000254647.6`.
- `tissue` — optional. GTEx tissue id, such as `Pancreas` or `Adipose_Subcutaneous`.
- `limit` — optional. From 1 to 20. Default 10. Results are sorted by median TPM descending.
## Result
Each item has `source`, `title`, `url`, `summary`, `gene`, `gencodeId`, `tissue`, `tissueLabel`, `median`, `unit`, `ontologyId`, and `dataset`.
Reuse `gene` when searching proteins or genes. Reuse `gencodeId` in `gencodeId` for an exact expression lookup. For gene–disease associations, use https://skills.duaer.com/targets.md.
## Credits
One successful search uses 1 credit.
An empty search, a failed search, a compound that matches nothing, or no remaining credits uses 0.
No remaining credits returns 402 and does not search.
A missing key returns 401.
常见问题
结果按什么排序?
按各组织中位 TPM 从高到低;Limit 截取前 N 条。
同组
入门
在 Duaer 里检索基因
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索基因。一次成功查询 1 额度。符号可用于蛋白 Gene。本页含完整英文调用技能。
入门在 Duaer 里检索基因和蛋白
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索基因和蛋白。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。
入门在 Duaer 里检索互作
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索 STRING 蛋白互作伙伴。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。
入门在 Duaer 里检索靶点关联
在 Duaer 里用 Duaer Data 检索 Open Targets 基因–疾病关联。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。
入门在 Duaer 里使用数据市场
在 Duaer 里,数据市场列出能取到的数据、能拿到什么、以及价格。侧栏在数据池正下方。打开目录不会发起检索。