Duaer

入门

在 Duaer 里检索 GEO

在 Duaer 里用 Duaer Data 检索 NCBI GEO 系列与数据集。一次成功查询 1 额度。本页含完整英文调用技能。

能拿到什么

Duaer 数据市场里的「GEO」返回 NCBI GEO 系列/数据集摘要(登录号、物种、类型、样本数)。一次成功查询 1 额度。

从节点创建器的 Duaer 数据分类 选「GEO」,或打开 数据市场 复制技能。组织表达中位 TPM 见 表达。

在画布里检索

  1. 打开节点创建器,点「Duaer 数据」,再选「GEO」。
  2. Words 必填(新节点默认 insulin)。可填关键词或登录号如 GSE10072。
  3. Organism、Entry type 可选(默认 gse)。Limit 默认 10,最大 20。点执行此步骤。

成功扣 1 额度。正式运行的交付进 数据池。

用 API 调用

  • GET https://api.duaer.com/v1/data/geo?...
  • Authorization: Bearer <Duaer key>
  • 必须提供 words。

密钥见 Duaer 公开 API 的身份验证。下方是与「复制技能」相同的英文技能。

调用技能(英文)

与数据市场「复制技能」一致。正文保持英文。

---
name: duaer-geo
description: >-
  Search NCBI GEO series and datasets through Duaer.
  One successful search uses 1 Duaer credit.
---

# Duaer GEO

Search NCBI GEO series and datasets through Duaer with a Duaer key.

## Call

`GET https://api.duaer.com/v1/data/geo?words=insulin&organism=Homo%20sapiens&entryType=gse&limit=10`

Header: `Authorization: Bearer <Duaer key>`

Use an account key or a model API key.

`words` is required.

- `words` — words in the GEO record, or an accession such as `GSE10072`.
- `organism` — optional. Scientific name (`Homo sapiens`). Look up names with https://skills.duaer.com/organisms.md.
- `entryType` — optional. `gse` (default), `gds`, `gpl`, `gsm`, or `any`.
- `limit` — optional. From 1 to 20. Default 10.

## Result

Each item has `source`, `title`, `url`, `summary`, `accession`, `uid`, `entryType`, `organism`, `datasetType`, `sampleCount`, `pubDate`, and `pubmedId`.
Reuse gene symbols from related studies when searching expression: https://skills.duaer.com/expression.md.

## Credits

One successful search uses 1 credit.
An empty search, a failed search, a compound that matches nothing, or no remaining credits uses 0.
No remaining credits returns 402 and does not search.
A missing key returns 401.

常见问题

默认只搜系列吗?

是。Entry type 默认为 gse;填 any 可包含 GDS/GPL/GSM。

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